FC Roskilde er etableret i 2004 og trådte i kraft 1. juli s.a., som en elite-overbygning på Himmelev-Veddelev Boldklub, Svogerslev Boldklub og Roskilde Boldklub af 1906. Overbygningen omhandlede fire hold, 1. senior, samt ungdomsholdene U19, U17, U15 og U14. Ret hurtigt sikrede holdet sig oprykning til 1. division (næstbedste række) i 2008. I 2013 måtte man erkende, at vedtægterne skulle ændres, for at kunne få skaffet kapital udefra. I 2015 trådte Himmelev-Veddelev og Svogerslev ud af samarbejdet, for at koncentrere sig mere om deres lokalområder, så det blev alene RB06, der driver overbygningen videre. Siden etableringen, har FCR befundet sig i 2. og 3. bedste række, med en afstikker til 4. bedste i 2021/22. Lige p.t. befinder FCR sig i 3. bedste række. I pokalturneringen er FCR højest kommet til 5. runde i 2015/16, hvor det blev til sejr over FC Midtjylland i 4. runde efter straffespark. AaB blev dog for stor en mundfuld i 5. runde, hvor man tabte med 4-0.